Publications

Hugo Horlings

2024

Does “One Size Fits All”? Rethinking FIGO Depth of Invasion Measurements in Vulvar Cancer

International Journal of Gynecological Pathology
M. C. Bleeker, T. Bosse, K. K. Van De Vijver, J. Bart, H. Horlings, T. G. Jonges, N. C. Visser, L. F. Kooreman, J. Bulten, P. C. Ewing-Graham, 2024

doi abstract
Abstract 4951: Integrative multi-omic machine learning model predicts neoadjuvant immunotherapy response using molecular data and deep learning-derived features from digital pathology

Cancer Research
L. V. Leek, V. Botha, V. A. Baxi, J. Teuwen, H. M. Horlings, S. D. Chasalow, J. V. D. Haar, L. F. Wessels, A. Debroy, E. E. Voest, 2024, 84;(6_Supplement):4951-4951

doi abstract
Image‐based multiplex immune profiling of cancer tissues: translational implications. A report of the International Immuno‐oncology Biomarker Working Group on Breast Cancer

The Journal of Pathology
C. A. Jahangir, D. B. Page, G. Broeckx, C. A. Gonzalez, C. Burke, C. Murphy, J. S. Reis‐Filho, A. Ly, P. W. Harms, R. R. Gupta, M. Vieth, A. I. Hida, M. Kahila, Z. Kos, P. J. Van Diest, S. Verbandt, J. Thagaard, R. Khiroya, K. Abduljabbar, G. Acosta Haab, B. Acs, S. Adams, J. S. Almeida, I. Alvarado‐Cabrero, F. Azmoudeh‐Ardalan, S. Badve, N. B. Baharun, E. R. Bellolio, V. Bheemaraju, K. R. Blenman, L. Botinelly Mendonça Fujimoto, O. Burgues, A. Chardas, M. C. U. Cheang, F. Ciompi, L. A. Cooper, A. Coosemans, G. Corredor, F. L. Dantas Portela, F. Deman, S. Demaria, S. N. Dudgeon, M. Elghazawy, C. Fernandez‐Martín, S. Fineberg, S. B. Fox, J. M. Giltnane, S. Gnjatic, P. I. Gonzalez‐Ericsson, A. Grigoriadis, N. Halama, M. G. Hanna, A. Harbhajanka, S. N. Hart, J. Hartman, S. Hewitt, H. M. Horlings, Z. Husain, S. Irshad, E. A. Janssen, T. R. Kataoka, K. Kawaguchi, A. I. Khramtsov, U. Kiraz, P. Kirtani, L. L. Kodach, K. Korski, G. Akturk, E. Scott, A. Kovács, A. Lænkholm, C. Lang‐Schwarz, D. Larsimont, J. K. Lennerz, M. Lerousseau, X. Li, A. Madabhushi, S. K. Maley, V. Manur Narasimhamurthy, D. K. Marks, E. S. Mcdonald, R. Mehrotra, S. Michiels, D. Kharidehal, F. U. A. A. Minhas, S. Mittal, D. A. Moore, S. Mushtaq, H. Nighat, T. Papathomas, F. Penault‐Llorca, R. D. Perera, C. J. Pinard, J. C. Pinto‐Cardenas, G. Pruneri, L. Pusztai, N. M. Rajpoot, B. L. Rapoport, T. T. Rau, J. M. Ribeiro, D. Rimm, A. Vincent‐Salomon, J. Saltz, S. Sayed, E. Hytopoulos, S. Mahon, K. P. Siziopikou, C. Sotiriou, A. Stenzinger, M. A. Sughayer, D. Sur, F. Symmans, S. Tanaka, T. Taxter, S. Tejpar, J. Teuwen, E. A. Thompson, T. Tramm, W. T. Tran, J. Van Der Laak, G. E. Verghese, G. Viale, N. Wahab, T. Walter, Y. Waumans, H. Y. Wen, W. Yang, Y. Yuan, J. Bartlett, S. Loibl, C. Denkert, P. Savas, S. Loi, E. Specht Stovgaard, R. Salgado, W. M. Gallagher, A. Rahman, 2024

doi abstract

2023

PatchSorter: A High Throughput Deep Learning Digital Pathology Tool for Object Labeling
C. Walker, T. Talawalla, R. Toth, A. Ambekar, K. Rea, O. Chamian, F. Fan, S. Berezowska, S. Rottenberg, A. Madabhushi, M. Maillard, L. Barisoni, H. M. Horlings, A. Janowczyk, 2023

ArXiv abstract
The prognostic value of tumor-stroma ratio and a newly developed computer-aided quantitative analysis of routine H&E slides in high-grade serous ovarian cancer
L. V. Wagensveld, C. Walker, K. Hahn, J. Sanders, R. Kruitwagen, M. V. D. Aa, G. Sonke, S. Rottenberg, K. V. De Vijver, A. Janowczyk, H. Horlings, 2023

doi abstract
Abstract P3-06-01: Unleashing NK- and CD8 T cells by combining monalizumab (anti-NKG2A) and trastuzumab for metastatic HER2+ breast cancer: first results MIMOSA trial

Cancer Research
V. Geurts, L. Voorwerk, K. Sikorska, R. Salgado, K. Van De Vijver, M. Van Dongen, I. Kemper, I. A. Mandjes, M. Heuver-Mes, J. Haanen, G. S. Sonke, H. Horlings, M. Kok, 2023, 83;(5_Supplement):P3-06-01-P3-06-01

doi abstract
RadioLOGIC, a healthcare model for processing electronic health records and decision-making in breast disease

Cell Reports Medicine
T. Zhang, T. Tan, X. Wang, Y. Gao, L. Han, L. Balkenende, A. D’Angelo, L. Bao, H. M. Horlings, J. Teuwen, R. G. Beets-Tan, R. M. Mann, 2023

doi abstract
PROACTING: predicting pathological complete response to neoadjuvant chemotherapy in breast cancer from routine diagnostic histopathology biopsies with deep learning

Breast Cancer Research
W. Aswolinskiy, E. Munari, H. M. Horlings, L. Mulder, G. Bogina, J. Sanders, Y. Liu, A. W. Van Den Belt-Dusebout, L. Tessier, M. Balkenhol, M. Stegeman, J. Hoven, J. Wesseling, J. Van Der Laak, E. H. Lips, F. Ciompi, 2023, 25;(1)

doi abstract
CMTM6 shapes antitumor T cell response through modulating protein expression of CD58 and PD-L1

Cancer Cell
B. Miao, Z. Hu, R. Mezzadra, L. Hoeijmakers, A. Fauster, S. Du, Z. Yang, M. Sator-Schmitt, H. Engel, X. Li, C. Broderick, G. Jin, R. Gomez-Eerland, L. Rozeman, X. Lei, H. Matsuo, C. Yang, I. Hofland, D. Peters, A. Broeks, E. Laport, A. Fitz, X. Zhao, M. A. Mahmoud, X. Ma, S. Sander, H. Liu, G. Cui, Y. Gan, W. Wu, Y. Xiao, A. J. Heck, W. Guan, S. W. Lowe, H. M. Horlings, C. Wang, T. R. Brummelkamp, C. U. Blank, T. N. Schumacher, C. Sun, 2023, 41;(10):1817-1828.e9

doi
B-cells and regulatory T-cells in the microenvironment of HER2+ breast cancer are associated with decreased survival: a real-world analysis of women with HER2+ metastatic breast cancer

Breast Cancer Research
T. G. Steenbruggen, D. M. Wolf, M. J. Campbell, J. Sanders, S. Cornelissen, B. Thijssen, R. A. Salgado, C. Yau, N. O-Grady, A. Basu, R. Bhaskaran, L. Mittempergher, G. L. Hirst, J. Coppe, M. Kok, G. S. Sonke, L. J. Van ‘T Veer, H. M. Horlings, 2023, 25;(1)

doi abstract
Characterization of the Tumor Microenvironment of De Novo Oligometastatic Breast Cancer in a Nationwide Cohort

JCO Precision Oncology
T. G. Steenbruggen, D. M. Wolf, B. Thijssen, J. Sanders, S. Cornelissen, R. Salgado, L. Mittempergher, R. Bhaskaran, A. Broeks, E. H. Lips, S. Siesling, G. S. Sonke, H. M. Horlings, L. J. Van ’T Veer, 2023

doi abstract
Immune landscape of breast tumors with low and intermediate estrogen receptor expression

npj Breast Cancer
L. Voorwerk, J. Sanders, M. S. Keusters, S. Balduzzi, S. Cornelissen, M. Duijst, E. H. Lips, G. S. Sonke, S. C. Linn, H. M. Horlings, M. Kok, 2023, 9;(1)

doi abstract
PD-L1 blockade in combination with carboplatin as immune induction in metastatic lobular breast cancer: the GELATO trial

Nature Cancer
L. Voorwerk, O. I. Isaeva, H. M. Horlings, S. Balduzzi, M. Chelushkin, N. A. M. Bakker, E. Champanhet, H. Garner, K. Sikorska, C. E. Loo, I. Kemper, I. A. M. Mandjes, M. De Maaker, J. J. L. Van Geel, J. Boers, M. De Boer, R. Salgado, M. G. J. Van Dongen, G. S. Sonke, K. E. De Visser, T. N. Schumacher, C. U. Blank, L. F. A. Wessels, A. Jager, V. C. G. Tjan-Heijnen, C. P. Schröder, S. C. Linn, M. Kok, 2023, 4;(4):535-549

doi abstract
Predicting breast cancer types on and beyond molecular level in a multi-modal fashion

npj Breast Cancer
T. Zhang, T. Tan, L. Han, L. Appelman, J. Veltman, R. Wessels, K. M. Duvivier, C. Loo, Y. Gao, X. Wang, H. M. Horlings, R. G. H. Beets-Tan, R. M. Mann, 2023, 9;(1)

doi abstract
Spatial analyses of immune cell infiltration in cancer: current methods and future directions. A report of the International Immuno‐Oncology Biomarker Working Group on Breast Cancer

The Journal of Pathology
D. B. Page, G. Broeckx, C. A. Jahangir, S. Verbandt, R. R. Gupta, J. Thagaard, R. Khiroya, Z. Kos, K. Abduljabbar, G. Acosta Haab, B. Acs, J. S. Almeida, I. Alvarado‐Cabrero, F. Azmoudeh‐Ardalan, S. Badve, N. B. Baharun, E. R. Bellolio, V. Bheemaraju, K. R. Blenman, L. Botinelly Mendonça Fujimoto, O. Burgues, M. C. U. Cheang, F. Ciompi, L. A. Cooper, A. Coosemans, G. Corredor, F. L. Dantas Portela, F. Deman, S. Demaria, S. N. Dudgeon, M. Elghazawy, S. Ely, C. Fernandez‐Martín, S. Fineberg, S. B. Fox, W. M. Gallagher, J. M. Giltnane, S. Gnjatic, P. I. Gonzalez‐Ericsson, A. Grigoriadis, N. Halama, M. G. Hanna, A. Harbhajanka, A. Hardas, S. N. Hart, J. Hartman, S. Hewitt, A. I. Hida, H. M. Horlings, Z. Husain, E. Hytopoulos, S. Irshad, E. A. Janssen, M. Kahila, T. R. Kataoka, K. Kawaguchi, D. Kharidehal, A. I. Khramtsov, U. Kiraz, P. Kirtani, L. L. Kodach, K. Korski, A. Kovács, A. Laenkholm, C. Lang‐Schwarz, D. Larsimont, J. K. Lennerz, M. Lerousseau, X. Li, A. Ly, A. Madabhushi, S. K. Maley, V. Manur Narasimhamurthy, D. K. Marks, E. S. Mcdonald, R. Mehrotra, S. Michiels, F. U. A. A. Minhas, S. Mittal, D. A. Moore, S. Mushtaq, H. Nighat, T. Papathomas, F. Penault‐Llorca, R. D. Perera, C. J. Pinard, J. C. Pinto‐Cardenas, G. Pruneri, L. Pusztai, A. Rahman, N. M. Rajpoot, B. L. Rapoport, T. T. Rau, J. S. Reis‐Filho, J. M. Ribeiro, D. Rimm, A. Salomon, M. Salto‐Tellez, J. Saltz, S. Sayed, K. P. Siziopikou, C. Sotiriou, A. Stenzinger, M. A. Sughayer, D. Sur, F. Symmans, S. Tanaka, T. Taxter, S. Tejpar, J. Teuwen, E. A. Thompson, T. Tramm, W. T. Tran, J. Van Der Laak, P. J. Van Diest, G. E. Verghese, G. Viale, M. Vieth, N. Wahab, T. Walter, Y. Waumans, H. Y. Wen, W. Yang, Y. Yuan, S. Adams, J. M. S. Bartlett, S. Loibl, C. Denkert, P. Savas, S. Loi, R. Salgado, E. Specht Stovgaard, G. Akturk, N. Bouchmaa, 2023

doi abstract
Pitfalls in machine learning‐based assessment of tumor‐infiltrating lymphocytes in breast cancer: A report of the International Immuno‐Oncology Biomarker Working Group on Breast Cancer

The Journal of Pathology
J. Thagaard, G. Broeckx, D. B. Page, C. A. Jahangir, S. Verbandt, Z. Kos, R. Gupta, R. Khiroya, K. Abduljabbar, G. Acosta Haab, B. Acs, G. Akturk, J. S. Almeida, I. Alvarado‐Cabrero, M. Amgad, F. Azmoudeh‐Ardalan, S. Badve, N. B. Baharun, E. Balslev, E. R. Bellolio, V. Bheemaraju, K. R. Blenman, L. Botinelly Mendonça Fujimoto, N. Bouchmaa, O. Burgues, A. Chardas, M. Chon U Cheang, F. Ciompi, L. A. Cooper, A. Coosemans, G. Corredor, A. B. Dahl, F. L. Dantas Portela, F. Deman, S. Demaria, J. Doré Hansen, S. N. Dudgeon, T. Ebstrup, M. Elghazawy, C. Fernandez‐Martín, S. B. Fox, W. M. Gallagher, J. M. Giltnane, S. Gnjatic, P. I. Gonzalez‐Ericsson, A. Grigoriadis, N. Halama, M. G. Hanna, A. Harbhajanka, S. N. Hart, J. Hartman, S. Hauberg, S. Hewitt, A. I. Hida, H. M. Horlings, Z. Husain, E. Hytopoulos, S. Irshad, E. A. Janssen, M. Kahila, T. R. Kataoka, K. Kawaguchi, D. Kharidehal, A. I. Khramtsov, U. Kiraz, P. Kirtani, L. L. Kodach, K. Korski, A. Kovács, A. Laenkholm, C. Lang‐Schwarz, D. Larsimont, J. K. Lennerz, M. Lerousseau, X. Li, A. Ly, A. Madabhushi, S. K. Maley, V. Manur Narasimhamurthy, D. K. Marks, E. S. Mcdonald, R. Mehrotra, S. Michiels, F. U. A. A. Minhas, S. Mittal, D. A. Moore, S. Mushtaq, H. Nighat, T. Papathomas, F. Penault‐Llorca, R. D. Perera, C. J. Pinard, J. C. Pinto‐Cardenas, G. Pruneri, L. Pusztai, A. Rahman, N. M. Rajpoot, B. L. Rapoport, T. T. Rau, J. S. Reis‐Filho, J. M. Ribeiro, D. Rimm, A. Roslind, A. Vincent‐Salomon, M. Salto‐Tellez, J. Saltz, S. Sayed, E. Scott, K. P. Siziopikou, C. Sotiriou, A. Stenzinger, M. A. Sughayer, D. Sur, S. Fineberg, F. Symmans, S. Tanaka, T. Taxter, S. Tejpar, J. Teuwen, E. A. Thompson, T. Tramm, W. T. Tran, J. Van Der Laak, P. J. Van Diest, G. E. Verghese, G. Viale, M. Vieth, N. Wahab, T. Walter, Y. Waumans, H. Y. Wen, W. Yang, Y. Yuan, R. M. Zin, S. Adams, J. Bartlett, S. Loibl, C. Denkert, P. Savas, S. Loi, R. Salgado, E. Specht Stovgaard, 2023, 260;(5):498-513

doi abstract
1240P Multi-centric validation of an AI-based sTIL% scoring model for breast cancer H&E whole-slide images

Annals of Oncology
Y. Schirris, R. Voorthuis, M. Opdam, E. Gavves, R. De Menezes, S. Linn, H. Horlings, 2023, 34

doi
474P ctDNA-based copy number dynamics during anti-PD1 treatment in patients with metastatic triple-negative breast cancer

Annals of Oncology
A. Lin, O. Isaeva, D. Vessies, T. Deger, L. Voorwerk, V. Geurts, H. Horlings, J. Martens, L. Wessels, D. Van Den Broek, M. Kok, 2023, 34

doi
163MO Single-cell T cell dynamics induced by neoadjuvant nivolumab +/- ipilimumab in early triple negative breast cancer with tumor-infiltrating lymphocytes (BELLINI trial)

Immuno-Oncology and Technology
O. Isaeva, I. Nederlof, M. De Graaf, B. Boeckx, J. Traets, I. Mandjes, K. Van De Vijver, M. Chelushkin, C. Drukker, M. Dongen, G. Sonke, S. Linn, C. Blank, K. De Visser, R. Salgado, L. Wessels, T. Schumacher, H. Horlings, D. Lambrechts, M. Kok, 2023, 20

doi
Unleashing NK- and CD8 T cells by combining monalizumab and trastuzumab for metastatic HER2-positive breast cancer: Results of the MIMOSA trial

The Breast
V. Geurts, L. Voorwerk, S. Balduzzi, R. Salgado, K. Van De Vijver, M. Van Dongen, I. Kemper, I. Mandjes, M. Heuver, W. Sparreboom, J. Haanen, G. Sonke, H. Horlings, M. Kok, 2023, 70

doi
BluePrint molecular subtypes predict response to neoadjuvant pertuzumab in HER2-positive breast cancer

Breast Cancer Research
M. C. Liefaard, A. Van Der Voort, M. S. Van Ramshorst, J. Sanders, S. Vonk, H. M. Horlings, S. Siesling, L. De Munck, A. E. Van Leeuwen, M. Kleijn, L. Mittempergher, M. M. Kuilman, A. M. Glas, J. Wesseling, E. H. Lips, G. S. Sonke, 2023, 25;(1)

doi abstract

2022

DeepSMILE: Contrastive self-supervised pre-training benefits MSI and HRD classification directly from H&E whole-slide images in colorectal and breast cancer

Medical Image Analysis
Y. Schirris, E. Gavves, I. Nederlof, H. M. Horlings, J. Teuwen, 2022, 79

doi
HRD-related morphology discovery in breast cancer by controlling for confounding factors

Cell Reports Medicine
Y. Schirris, H. M. Horlings, 2022, 3;(12):100873

doi
WeakSTIL: weak whole-slide image level stromal tumor infiltrating lymphocyte scores are all you need

Medical Imaging 2022: Digital and Computational Pathology
Y. Schirris, M. Engelaer, A. Panteli, H. M. Horlings, E. Gavves, J. Teuwen, 2022

doi preprints
Establishment of the Dutch Nationwide, Interdisciplinary Infrastructure and Biobank for Fundamental and Translational Ovarian Cancer Research: Archipelago of Ovarian Cancer Research

Gynecologic and Obstetric Investigation
H. S. Zelisse, M. D. Van Gent, S. De Ridder, M. A. Van Der Aa, A. M. Van Altena, J. Bart, J. A. Belien, I. A. Boere, S. L. Bosch, A. Broeks, J. Bulten, M. Collée, F. H. Groenendijk, H. M. Horlings, M. P. Jansen, T. G. Jonges, L. F. Kooreman, C. D. De Kroon, S. Lambrechts, C. A. Lok, J. M. Piek, A. K. Reyners, E. Roes, M. Simons, G. B. A. Wisman, R. Yigit, R. P. Zweemer, C. H. Mom, M. J. Van De Vijver, F. Dijk, 2022, 87;(6):389-397

doi abstract

2021

Sparse-shot learning with exclusive cross-entropy for extremely many localisations

Proceedings of the IEEE/CVF International Conference on Computer Vision (ICCV)
A. Panteli, J. Teuwen, H. Horlings, E. Gavves, 2021

url preprints